Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mesp2O08574 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mesp2O08574 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms