Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna3O08545 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms