Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d1O08532 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d1O08532 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d1O08532 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d1O08532 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms