Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Gm3488M0QW81 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Gm3488M0QW81 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Gm3488M0QW81 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3488M0QW81 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3488M0QW81 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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