Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim34bJ3QNR8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim34bJ3QNR8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms