Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pot1bH7BX60 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pot1bH7BX60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pot1bH7BX60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms