Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf4bG5E8Z2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf4bG5E8Z2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms