Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3tc1G3X9F6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3tc1G3X9F6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3tc1G3X9F6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms