Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5160F8VPN3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5160F8VPN3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5160F8VPN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5160F8VPN3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms