Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm28038F7BCN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28038F7BCN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm28038F7BCN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28038F7BCN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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