Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Sptbn5F6UCX4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sptbn5F6UCX4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms