Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700113H08RikE9Q9Q5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700113H08RikE9Q9Q5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700113H08RikE9Q9Q5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms