Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5R7

Nlrp12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp12E9Q5R7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nlrp12E9Q5R7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp12E9Q5R7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms