Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nolc1E9Q5C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nolc1E9Q5C9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nolc1E9Q5C9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms