Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd1E9Q3H4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd1E9Q3H4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms