Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4f2E9Q366 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4f2E9Q366 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f2E9Q366 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms