Protein–RNA interactions for Protein: E9Q365

Vmn1r101, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r101E9Q365 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r101E9Q365 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r101E9Q365 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r101E9Q365 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r101E9Q365 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r101E9Q365 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r101E9Q365 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r101E9Q365 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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