Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430550D23RikE9Q1X6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
6430550D23RikE9Q1X6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
6430550D23RikE9Q1X6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms