Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3250E9Q1M3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3250E9Q1M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3250E9Q1M3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms