Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Zfp558E9Q1J0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Zfp558E9Q1J0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Zfp558E9Q1J0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zfp558E9Q1J0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zfp558E9Q1J0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
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