Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt78E9Q0F0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt78E9Q0F0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt78E9Q0F0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms