Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clca3bE9PUL3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca3bE9PUL3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms