Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc78D3Z5T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc78D3Z5T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc78D3Z5T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms