Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm42791D3YYB5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm42791D3YYB5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm42791D3YYB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms