Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kif28pD3YXS5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kif28pD3YXS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms