Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc170D3YXL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc170D3YXL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms