Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl10D3YWW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl10D3YWW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms