Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mfap1bC0HKD9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mfap1bC0HKD9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfap1bC0HKD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms