Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smok3bC0HKC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smok3bC0HKC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms