Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pnldc1B2RXZ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms