Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc11B2RXC1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms