Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt4B2RU40 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prrt4B2RU40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt4B2RU40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms