Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf518bB2RRE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518bB2RRE4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms