Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU022751B1B0V2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AU022751B1B0V2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AU022751B1B0V2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms