Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll11A4Q9F4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ttll11A4Q9F4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttll11A4Q9F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms