Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc38A3KMP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc38A3KMP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms