Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms