Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Btbd35f28A2CFD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms