Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb1A2AQ07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms