Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cavin4A2AMM0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cavin4A2AMM0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin4A2AMM0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms