Protein–RNA interactions for Protein: A2AKP6

Gm12394, Predicted gene 12394, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12394A2AKP6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12394A2AKP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm12394A2AKP6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm12394A2AKP6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms