Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5938A2AEN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Gm5938A2AEN9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Gm5938A2AEN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Gm5938A2AEN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Gm5938A2AEN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm5938A2AEN9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm5938A2AEN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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