Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700023F06RikA2AB62 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700023F06RikA2AB62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700023F06RikA2AB62 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms