Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbf1A2A870 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms