Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb4A2A863 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb4A2A863 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms