Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp1bA1Z198 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms