Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc173A0JLY1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc173A0JLY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms