Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms