Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms