Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Trbv4A0A075B5I2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv4A0A075B5I2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv4A0A075B5I2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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